Основные индикаторы
Данные с задержкой 15 мин.
USD/RUB
–0,23
59,00
EUR/RUB
+0,01
69,42
РТС
–0,60%
1027,85
ММВБ
–0,56%
1930,71
Brent
+1,89%
52,84
Золото
–0,36%
1289,50
S&P500
–0,18%
2425,55
NASDAQ
–0,09%
6216,53
FTSE 100
–0,86%
7323,98
NIKKEI
–0,42%
19388,12
Срочно
IT и медиа

Российские ученые создали программу для анализа метагеномов

Ученые из Университета ИТМО, ФНКЦ физико-химической медицины и МФТИ разработали программу, которая позволяет быстро сравнивать между собой совокупности ДНК микроорганизмов, обитающих в разных средах.

Исследователи уже предложили несколько вариантов применения новой программы на практике. Так, сравнив при помощи алгоритма микрофлору здорового человека с микрофлорой больного, можно быстро выявить ранее неизвестные патогенные организмы, а также их штаммы, что поможет в разработке средств персонализированной медицины. Результаты исследования опубликованы в журнале Bioinformatics.

У каждого человека есть геном – особая последовательность генов, в соответствии с которой развивается индивид. Однако любой живой организм содержит еще одну последовательность генов, которая называется метагеном и представляет собой совокупность ДНК самых различных микроорганизмов, обитающих в одной среде: бактерий, грибов, вирусов. Метагеном часто является индикатором различных заболеваний и предрасположенности к ним. Поэтому изучение микробиоты, то есть совокупности микроорганизмов, населяющих различные отделы человеческого организма, занимает особое место в метагеномных исследованиях.

Программный инструмент под названием MetaFast, разработанный учеными, позволяет провести быстрый сравнительный анализ большого количества метагеномов.

“При исследовании микрофлоры кишечника пациентов могут быть выявлены микроорганизмы, ассоциируемые с каким-либо заболеванием, например, с диабетом или предрасположенностью к нему. А это уже предпосылки для применения персонализированной медицины и создания новых лекарств. Оперируя результатами работы программы, биологи могут сделать выводы о том, в каком направлении двигаться, поскольку алгоритм позволяет исследовать среды, о которых мы еще ничего не знаем”, – рассказывает главный разработчик алгоритма Владимир Ульянцев, сотрудник Международной лаборатории “Компьютерные технологии” Университета ИТМО.

Одной из ключевых особенностей программы является возможность успешно работать со средами, генетическое содержимое которых ранее не было изучено. С помощью программы можно проводить нецелевой экспресс-анализ маркеров, указывающих на наличие каких-либо заболеваний. По словам ученых, программа потенциально способна сократить сроки создания новых лекарств в несколько раз.

Диапазон применения MetaFast не ограничивается обнаружением патогенных микроорганизмов. К примеру, сравнение метагеномов самобытных народов в замкнутых популяциях с жителями городов может помочь выделить бактериальные штаммы, крайне полезные для людей, но утерянные в процессе урбанизации.

В мире уже накоплено гигантское количество экспериментальных данных по различным метагеномам. Благодаря тому, что стоимость извлечения ДНК уменьшается, а чувствительность оборудования увеличивается, объемы этих данных продолжают расти экспоненциально. Но при этом большая часть исследований не доведена до конца. Причина – в существующих технологиях. С одной стороны, ученые могут частично собрать метагеном, но на сборку “мозаики” уходит колоссальное количество времени. С другой стороны, они могут сравнить отдельные кусочки генома с уже известными базами ДНК, в которых, однако, приведено очень ограниченное число бактерий, а вирусов практически нет.

Разработанный алгоритм сочетает в себе сильные стороны этих двух подходов и при этом обеспечивает хорошую скорость обработки данных. Программа экономит оперативную память именно благодаря тому, что частично собирает, частично сравнивает геномы, но не вдается в глубокий сборочный анализ.

Главные события

Промсвязьбанк вышел из состава кредиторов московского долгостроя ЖК «Царицыно»

Промсвязьбанк вышел из состава кредиторов московского долгостроя ЖК «Царицыно»

Потребительские рынки

Интервью  

все интервью
Цифра дня
100
млрд рублей
  • рассчитывала привлечь «Система» от IPO «Башнефти», заявил представитель АФК в суде
  • алиментов взыскали судебные приставы в России за полгода
  • американцев относятся к России с симпатией, согласно исследованию Pew Research Center
  • жителей России утверждают, что не употребляют алкоголь
  • превысил курс биткоина
  • санкционных продуктов уничтожил Россельхознадзор с момента введения продэмбарго
  • машин Skoda отзывают в России из-за дефектов
  • объем нарушений, выявленный Счетной палатой в первом полугодии 2017 года
  • составил крупнейший транспортный налог в России, выписанный владельцу Bugatti
1из10
  • «Правильно будет признать Крым в составе России… Крым уже никогда не вернется в состав Украины. Санкции ничего не дают. Россия — это сила в Европе, и мы должны интегрировать ее в европейский порядок»
    Цитата дня: Александр Гауланд, зампредседателя партии «Альтернатива для Германии»
    Александр Гауланд,  зампредседателя партии «Альтернатива для Германии»
  • «В ЕС скептически относятся к новому "плану Маршалла" для Украины: вкладывать ежегодно €5 млрд в черную дыру киевской коррупции желающих мало»
    Цитата дня: Алексей Пушков, председатель комиссии Совфеда по информполитике
    Алексей Пушков,  председатель комиссии Совфеда по информполитике
  • «Забудьте об этом (войне с КНДР. — RNS). Пока кто-нибудь не найдет решение, при котором я пойму, что 10 млн людей в Сеуле не погибнут в первые 30 минут, я не знаю, о чем тут можно говорить»
    Цитата дня: Стивен Бэннон, советник президента США
    Стивен Бэннон,  советник президента США
  • «В науке отрицательный результат — тоже результат. Я думаю, что в историческом смысле (дело против Улюкаева. — RNS) принесет пользу русскому народу. Может быть, кто-то чему-то научится»
    Цитата дня: Алексей Улюкаев, бывший глава Минэкономразвития
    Алексей Улюкаев,  бывший глава Минэкономразвития
  • «США не будут стоять в стороне и ждать, пока Венесуэла свалится в диктатуру. Недееспособное государство в Венесуэле ставит под угрозу безопасность и благополучие всего Западного полушария»
    Цитата дня: Майк Пенс, вице-президент США
    Майк Пенс,  вице-президент США
  • «Целью нашей кампании мирного давления (на КНДР. — RNS) является денуклеаризация Корейского полуострова. США не заинтересованы в смене режима или ускорении воссоединения Кореи»
    Цитата дня: Рекс Тиллерсон, госсекретарь США
    Рекс Тиллерсон,  госсекретарь США
  • «Занимайтесь своими делами и решайте свои собственные проблемы, господин Трамп. Если на Венесуэлу нападут, винтовки прибудут в Нью-Йорк, господин Трамп. Мы возьмем штурмом Белый дом»
    Цитата дня: Николас Мадуро-младший, сын президента Венесуэлы
    Николас Мадуро-младший,  сын президента Венесуэлы
  • «Сейчас модель глобализации... которую этот клуб избранных (западных стран. — RNS) под себя выстроил, — так называемая либеральная глобализация — она, по-моему, терпит фиаско»
    Цитата дня: Сергей Лавров, министр иностранных дел России
    Сергей Лавров,  министр иностранных дел России
  • «Никакого запрета (фильма «Матильда». — RNS) не будет! В Чечне и так не станут тратить время на просмотр безнравственного, бездуховного и аморального по отношению к своей родине фильма»
    Цитата дня: Рамзан Кадыров, Глава Чечни
    Рамзан Кадыров,  Глава Чечни
1из10
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в СМИ 
  1. Игорь Комаров, Руководитель государственной корпорации по космической деятельности «Роскосмос»
    Игорь Комаров
    Руководитель государственной корпорации по космической деятельности «Роскосмос»
  2. Марк Цукерберг, Основатель и глава Facebook Inc.
    Марк Цукерберг
    Основатель и глава Facebook Inc.
  3. Михаил Прохоров, Российский политик и предприниматель, миллиардер
    Михаил Прохоров
    Российский политик и предприниматель, миллиардер
  4. Илон Маск, Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
    Илон Маск
    Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
  5. Виктор Вексельберг, Президент фонда «Сколково», председатель совета директоров группы компаний «Ренова»
    Виктор Вексельберг
    Президент фонда «Сколково», председатель совета директоров группы компаний «Ренова»
  6. Алексей Хотин, Российский предприниматель
    Алексей Хотин
    Российский предприниматель
  7. Алишер Усманов, Основатель USM Holdings
    Алишер Усманов
    Основатель USM Holdings
  8. Андрей Костин, Президент — председатель правления ВТБ
    Андрей Костин
    Президент — председатель правления ВТБ
  9. Павел Дуров, Основатель социальной сети «ВКонтакте» и мессенджера Telegram
    Павел Дуров
    Основатель социальной сети «ВКонтакте» и мессенджера Telegram
  10. Билл Гейтс, Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
    Билл Гейтс
    Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских СМИ по данным Медиалогии за неделю
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в соцсетях 
  1. Роман Абрамович, Российский предприниматель, миллиардер
    Роман Абрамович
    Российский предприниматель, миллиардер
  2. Евгений Касперский, Генеральный директор «Лаборатории Касперского»
    Евгений Касперский
    Генеральный директор «Лаборатории Касперского»
  3. Андрей Костин, Президент — председатель правления ВТБ
    Андрей Костин
    Президент — председатель правления ВТБ
  4. Герман Греф, Президент и председатель правления Сбербанка России
    Герман Греф
    Президент и председатель правления Сбербанка России
  5. Билл Гейтс, Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
    Билл Гейтс
    Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
  6. Александр Медведев, Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
    Александр Медведев
    Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
    место
  7. Михаил Прохоров, Российский политик и предприниматель, миллиардер
    Михаил Прохоров
    Российский политик и предприниматель, миллиардер
  8. Сергей Галицкий, Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
    Сергей Галицкий
    Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
  9. Илон Маск, Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
    Илон Маск
    Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
  10. Дональд Трамп, Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    Дональд Трамп
    Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    место
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских соцсетях по данным ВКонтакте за месяц

Вакансии

  • Директор по продукту Рay Day

  • Начальник Отдела анализа корпоративных рисков

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы аналитики данных

    Опыт более 6 лет
  • Директор по развитию бизнеса (облачная телефония)

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель PR-проектов

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы урегулирования проблемной задолженности

    Опыт 1–3 года
  • Начальник отдела электронной коммерции Департамента Эквайринга

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов (разработка под мобильные платформы)

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель направления развития бизнеса

  • Директор направления Digital по розничным продуктам

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов по развитию собственных производств

    Опыт более 6 лет