Срочно
IT и медиа

Российские ученые создали программу для анализа иммунитета

Группа учёных из Института биоорганической химии РАН разработала многофункциональный браузер VDJviz для работы с большими объёмами данных, получаемых с помощью современных средств анализа последовательностей ДНК. Результаты работы опубликованы в журнале BMC Genomics.

Разработка позволит ускорить процесс анализа данных новой области знаний – иммуногеномики, что поможет создать методы терапии серьёзных заболеваний, связанных с нарушением формирования и функционирования системы адаптивного иммунитета.

«Программа получила своё название – VDJviz – от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител (или иммуноглобулинов – растворимой формы антиген-распознающего рецептора В-клеток): V – variable, D – diversity и J – joining. Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета – защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», - отметил кандидат биологических наук, научный сотрудник Лаборатории сравнительной и функциональной геномики Института биоорганической химии РАН Иван Звягин.

В ходе VDJ-рекомбинации по одному фрагменту из каждой группы V, D и J соединяются вместе, образуя уникальную последовательность, кодирующую антиген-распознающий участок рецептора. Такой процесс происходит в организме множество раз при созревании каждой В- или Т-клетки, в результате чего формируется огромный набор В- и Т-клеток каждая из которых имеет уникальную структуру антиген-распознающего рецептора. Вся совокупность вариантов структуры этих рецепторов называется В- или Т-клеточным репертуаром.

Авторы работы отмечают, что cовременные методы молекулярной биологии позволяют определять кодируюущие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов – технология RepSeq. Обработка таких данных с помощью различных инструментов биоинформатики помогает исследователям восстанавливать репертуары клеток системы адаптивного иммунитета.

Основными преимуществами программы являются: поддержка форматов шести самых популярных инструментов для обработки данных RepSeq (MiTCR, MIGEC, MiXCR, IgBlast, IMGTHighVQuest, ImmunoSEQ), удобный графический интерфейс, наглядное представление характеристик последовательностей гипервариабельных рецепторов, возможность сравнения образцов между собой по многим параметрам, удобный экспорт полученных данных.

Комментарии

Главные события

Правительство выдвинуло экс-министра обороны Сердюкова в совет директоров ОАК

Правительство выдвинуло экс-министра обороны Сердюкова в совет директоров ОАК

Промышленность

Интервью  

все интервью
Цифра дня
2,5
трлн баррелей
  • технически извлекаемых запасов нефти осталось в мире, по оценке BP
  • может потерять экономика Франции в случае выхода страны из еврозоны
  • выделило правительство на подготовку Универсиады-2019 в Красноярске
  • могут достигнуть затраты на строительство домов в Москве вместо «хрущевок»
  • отзывает Honda в России из-за проблем с подушками безопасности
  • составит совокупная стоимость жилой недвижимости Москвы через пять лет
  • объем размещения акций российскими компаниями с начала 2017 года, достигший максимума за шесть лет
  • планируют построить власти Китая к 2020 году
  • составил рост промышленного производства в России в январе 2017 года по сравнению с январем 2016 года
1из10
  • «Общее сокращение стран ОПЕК и не ОПЕК позволило сократить дисбаланс между спросом и предложением. Цены стабилизировались, рынок стал менее волатильным... и мы видим возврат инвестиций»
    Цитата дня: Александр Новак, министр энергетики РФ
    Александр Новак,  министр энергетики РФ
  • «Я знаю ожидания москвичей. Ожидания связаны с тем, чтобы эти дома ("хрущевки") снести и на их месте новое жилье построить. Мне представляется, что это и было бы самым правильным решением»
    Цитата дня: Владимир Путин, президент России
    Владимир Путин,  президент России
  • «Когда бюджет Минсельхоза составляет 220 млрд руб., а потери нашей основной отрасли — хлебопечения — составляют 60 млрд руб., это чудовищные пропорции... Нужно принимать экстренные меры»
    Цитата дня: Ирина Яровая, вице-спикер Госдумы
    Ирина Яровая,  вице-спикер Госдумы
  • «Это оружие, которое способно преодолеть и сегодняшнюю, и завтрашнюю, и послезавтрашнюю ПРО США. Мы разорвем эту оборону»
    Цитата дня: Дмитрий Рогозин, вице-премьер России
    Дмитрий Рогозин,  вице-премьер России
  • «Мы тоже хотим, чтобы Минские договоренности выполнялись и мы свои санкции против Евросоюза не снимем, пока Минские договоренности не будут выполнены»
    Цитата дня: Сергей Лавров , Министр иностранных дел России
    Сергей Лавров ,  Министр иностранных дел России
  • «Есть ещё десяток процессов, не меньшего, а большего масштаба, чем Трамп, которые привели к тому, что может быть охарактеризовано как разрушение основ мировой политической архитектуры. Вот что произошло»
    Цитата дня: Анатолий Чубайс, глава УК «Роснано»
    Анатолий Чубайс,  глава УК «Роснано»
  • «Наедут на нас завтра, и этот бизнес рухнет в сутки, не будет ни Коропачинского (партнера «Роснано» в проекте OCSiAl. — RNS), ни меня, ни бизнеса. Уничтожить эту историю можно легко, за сутки»
    Цитата дня: Анатолий Чубайс, глава УК «Роснано»
    Анатолий Чубайс,  глава УК «Роснано»
  • «Идет кампания дискредитации против сделки (по приватизации "Роснефти". — RNS). Я откровенно вам говорю: никакой интриги нет, сделка очень транспарентная, естественно, сложная, комплексная»
    Цитата дня: Антонио Фаллико, глава Банка Интеза
    Антонио Фаллико,  глава Банка Интеза
  • «Я буду работать там, куда поставит президент: могу туалеты мыть, могу быть губернатором. Я человек служивый, всю жизнь служу государству и, как вы поняли из газет, не очень бедный»
    Цитата дня: Андрей Бельянинов, экс-глава ФТС
    Андрей Бельянинов,  экс-глава ФТС
1из10
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в СМИ 
  1. Олег Белозеров, Президент ОАО «Российские железные дороги»
    Олег Белозеров
    Президент ОАО «Российские железные дороги»
  2. Игорь Сечин, Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
    Игорь Сечин
    Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
  3. Юрий Слюсарь, Президент ОАК
    Юрий Слюсарь
    Президент ОАК
  4. Виктор Вексельберг, Председатель совета директоров группы компаний «Ренова»
    Виктор Вексельберг
    Председатель совета директоров группы компаний «Ренова»
  5. Николя Мор, Генеральный директор ОАО «АвтоВАЗ»
    Николя Мор
    Генеральный директор ОАО «АвтоВАЗ»
  6. Сергей Горьков, Председатель Внешэкономбанка
    Сергей Горьков
    Председатель Внешэкономбанка
  7. Роман Абрамович, Российский предприниматель, миллиардер
    Роман Абрамович
    Российский предприниматель, миллиардер
  8. Алексей Миллер, Председатель правления и заместитель председателя совета директоров ПАО «Газпром»
    Алексей Миллер
    Председатель правления и заместитель председателя совета директоров ПАО «Газпром»
  9. Михаил Прохоров, Российский политик и предприниматель, миллиардер
    Михаил Прохоров
    Российский политик и предприниматель, миллиардер
  10. Герман Греф, Президент и председатель правления Сбербанка России
    Герман Греф
    Президент и председатель правления Сбербанка России
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских СМИ по данным Медиалогии за неделю
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в соцсетях 
  1. Игорь Сечин, Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
    Игорь Сечин
    Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
  2. Олег Белозеров, Президент ОАО «Российские железные дороги»
    Олег Белозеров
    Президент ОАО «Российские железные дороги»
  3. Александр Медведев, Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
    Александр Медведев
    Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
  4. Роман Абрамович, Российский предприниматель, миллиардер
    Роман Абрамович
    Российский предприниматель, миллиардер
  5. Билл Гейтс, Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
    Билл Гейтс
    Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
  6. Гейб Ньюэлл, Один из основателей и генеральный директор компании Valve
    Гейб Ньюэлл
    Один из основателей и генеральный директор компании Valve
    место
  7. Михаил Прохоров, Российский политик и предприниматель, миллиардер
    Михаил Прохоров
    Российский политик и предприниматель, миллиардер
  8. Анатолий Чубайс, Генеральный директор ОАО «Роснано»
    Анатолий Чубайс
    Генеральный директор ОАО «Роснано»
  9. Сергей Галицкий, Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
    Сергей Галицкий
    Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
  10. Дональд Трамп, Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    Дональд Трамп
    Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    место
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских соцсетях по данным ВКонтакте за месяц

Вакансии

  • Директор по продукту Рay Day

  • Начальник Отдела анализа корпоративных рисков

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы аналитики данных

    Опыт более 6 лет
  • Директор по развитию бизнеса (облачная телефония)

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель PR-проектов

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы урегулирования проблемной задолженности

    Опыт 1–3 года
  • Начальник отдела электронной коммерции Департамента Эквайринга

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов (разработка под мобильные платформы)

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель направления развития бизнеса

  • Директор направления Digital по розничным продуктам

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов по развитию собственных производств

    Опыт более 6 лет