Срочно
IT и медиа

Российские ученые создали программу для анализа иммунитета

Группа учёных из Института биоорганической химии РАН разработала многофункциональный браузер VDJviz для работы с большими объёмами данных, получаемых с помощью современных средств анализа последовательностей ДНК. Результаты работы опубликованы в журнале BMC Genomics.

Разработка позволит ускорить процесс анализа данных новой области знаний – иммуногеномики, что поможет создать методы терапии серьёзных заболеваний, связанных с нарушением формирования и функционирования системы адаптивного иммунитета.

«Программа получила своё название – VDJviz – от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител (или иммуноглобулинов – растворимой формы антиген-распознающего рецептора В-клеток): V – variable, D – diversity и J – joining. Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета – защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», - отметил кандидат биологических наук, научный сотрудник Лаборатории сравнительной и функциональной геномики Института биоорганической химии РАН Иван Звягин.

В ходе VDJ-рекомбинации по одному фрагменту из каждой группы V, D и J соединяются вместе, образуя уникальную последовательность, кодирующую антиген-распознающий участок рецептора. Такой процесс происходит в организме множество раз при созревании каждой В- или Т-клетки, в результате чего формируется огромный набор В- и Т-клеток каждая из которых имеет уникальную структуру антиген-распознающего рецептора. Вся совокупность вариантов структуры этих рецепторов называется В- или Т-клеточным репертуаром.

Авторы работы отмечают, что cовременные методы молекулярной биологии позволяют определять кодируюущие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов – технология RepSeq. Обработка таких данных с помощью различных инструментов биоинформатики помогает исследователям восстанавливать репертуары клеток системы адаптивного иммунитета.

Основными преимуществами программы являются: поддержка форматов шести самых популярных инструментов для обработки данных RepSeq (MiTCR, MIGEC, MiXCR, IgBlast, IMGTHighVQuest, ImmunoSEQ), удобный графический интерфейс, наглядное представление характеристик последовательностей гипервариабельных рецепторов, возможность сравнения образцов между собой по многим параметрам, удобный экспорт полученных данных.

Главные события

Nord Stream 2 подписала соглашения о финансировании «Северного потока — 2» на €4,75 млрд

Nord Stream 2 подписала соглашения о финансировании «Северного потока — 2» на €4,75 млрд

ТЭК

Интервью  

все интервью
Цифра дня
1,7
трлн долларов
  • составили глобальные военные расходы в 2016 году
  • составили расходы на Красноярский экономический форум в 2017 году
  • во столько по оценке главы ПФР обойдется бюджету индексация пенсий для работающих пенсионеров
  • достигло совокупное состояние 200 богатейших бизнесменов России
  • выделит ЦБ на санацию банка «Пересвет»
  • жителей России пользуются интернетом
  • сумма сделки по покупке девелопером ПИК компании «Мортон»
  • российских заемщиков в 2016 году потратили новые кредиты на погашение старых
  • потратили российские туристы в зарубежных поездках в 2016 году
1из10
  • «Было бы нереалистичным считать сейчас друг друга (Россию и ЕС. — RNS) стратегическими партнерами... Давайте не будем притворяться, что у нас с 2014 года ничего не изменилось в худшую сторону»
    Цитата дня: Федерика Могерини  , верховный представитель ЕС по иностранным делам
    Федерика Могерини ,  верховный представитель ЕС по иностранным делам
  • «Не надо поощрять иждивенчество — когда многие регионы старались поощрять внутреннее развитие, на чем-то экономили, а кто-то проводил безответственную экономическую политику, записывали себе расходы»
    Цитата дня: Сергей Пономаренко, вице-губернатор Красноярского края
    Сергей Пономаренко,  вице-губернатор Красноярского края
  • «Правительство Северной Кореи должно инвестировать в благосостояние своих многострадальных граждан, а не в оружие массового уничтожения»
    Цитата дня: Джули Бишоп, министр иностранных дел Австралии
    Джули Бишоп,  министр иностранных дел Австралии
  • «Я не могу найти рациональных объяснений, почему с зарплат даже ниже средних удерживается налог на доходы физических лиц. А если человек получает миллион рублей в год процентов, то он не платит ни рубля НДФЛ»
    Цитата дня: Илья Трунин , заместитель министра финансов РФ
    Илья Трунин ,  заместитель министра финансов РФ
  • «Последние 10 лет… это, в общем-то, для России потерянное десятилетие... Мы переходим от кризиса к кризису с небольшими передышками, и, в общем, нам похвастаться нечем»
    Цитата дня: Алексей Кудрин, глава ЦСР
    Алексей Кудрин,  глава ЦСР
  • «Использование конъюнктурных доходов создавало иллюзию благополучия. Таким образом, мы сами провоцировали экономические и бюджетные кризисы»
    Цитата дня: Антон Силуанов, министр финансов
    Антон Силуанов,  министр финансов
  • «Год прошел в режиме жесткой экономии ресурсов. Но он стал годом осознанных возможностей... Нас санкциями продолжают давить, нефть была дешевой, но мы научились использовать ситуацию»
    Цитата дня: Дмитрий Медведев, премьер-министр России
    Дмитрий Медведев,  премьер-министр России
  • «Известная бабушка (старушка-процентщица из "Преступления и наказания". — RNS) из Достоевского — очень скромный человек по сравнению с нашими сегодняшними ростовщиками»
    Цитата дня: Владимир Путин, президент России
    Владимир Путин,  президент России
  • «А в целом ситуация в экономике, действительно, за последний год изменилась. Наша экономика вошла в стадию роста. Мы наблюдали это и в конце прошлого года, и в начале этого года наблюдаем»
    Цитата дня: Дмитрий Медведев, премьер-министр РФ
    Дмитрий Медведев,  премьер-министр РФ
1из10
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в СМИ 
  1. Григорий Березкин, Владелец группы компаний ЕСН
    Григорий Березкин
    Владелец группы компаний ЕСН
  2. Илон Маск, Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
    Илон Маск
    Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
  3. Алексей Мордашов, Генеральный директор ОАО «Северсталь»
    Алексей Мордашов
    Генеральный директор ОАО «Северсталь»
  4. Роман Ротенберг, Предприниматель, менеджер, спортивный функционер
    Роман Ротенберг
    Предприниматель, менеджер, спортивный функционер
  5. Марк Цукерберг, Основатель и глава Facebook Inc.
    Марк Цукерберг
    Основатель и глава Facebook Inc.
  6. Михаил Фридман, Совладелец и председатель наблюдательного совета консорциума «Альфа-Групп»
    Михаил Фридман
    Совладелец и председатель наблюдательного совета консорциума «Альфа-Групп»
  7. Алишер Усманов, Основатель USM Holdings
    Алишер Усманов
    Основатель USM Holdings
  8. Игорь Сечин, Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
    Игорь Сечин
    Президент государственной нефтяной компании «Роснефть»
  9. Леонид Михельсон, Председатель правления и крупный акционер российской газовой компании ОАО «Новатэк»
    Леонид Михельсон
    Председатель правления и крупный акционер российской газовой компании ОАО «Новатэк»
  10. Герман Греф, Президент и председатель правления Сбербанка России
    Герман Греф
    Президент и председатель правления Сбербанка России
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских СМИ по данным Медиалогии за неделю
Рейтинг упоминаемости топ-менеджеров в соцсетях 
  1. Илон Маск, Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
    Илон Маск
    Канадско-американский инженер, предприниматель, изобретатель и инвестор, миллиардер
  2. Александр Медведев, Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
    Александр Медведев
    Заместитель председателя правления ПАО «Газпром», генеральный директор ООО «Газпром экспорт»
  3. Павел Дуров, Основатель социальной сети «ВКонтакте» и мессенджера Telegram
    Павел Дуров
    Основатель социальной сети «ВКонтакте» и мессенджера Telegram
  4. Роман Абрамович, Российский предприниматель, миллиардер
    Роман Абрамович
    Российский предприниматель, миллиардер
  5. Билл Гейтс, Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
    Билл Гейтс
    Предприниматель, филантроп, один из создателей и бывший крупнейший акционер компании Microsoft
  6. Герман Греф, Президент и председатель правления Сбербанка России
    Герман Греф
    Президент и председатель правления Сбербанка России
  7. Анатолий Чубайс, Генеральный директор ОАО «Роснано»
    Анатолий Чубайс
    Генеральный директор ОАО «Роснано»
  8. Михаил Прохоров, Российский политик и предприниматель, миллиардер
    Михаил Прохоров
    Российский политик и предприниматель, миллиардер
  9. Сергей Галицкий, Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
    Сергей Галицкий
    Основатель и совладелец крупнейшей розничной сети «Магнит», президент и владелец ФК «Краснодар»
  10. Дональд Трамп, Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    Дональд Трамп
    Американский бизнесмен и политический деятель, медиамагнат, писатель
    место
10из10
Рейтинг упоминаемости в российских соцсетях по данным ВКонтакте за месяц

Вакансии

  • Директор по продукту Рay Day

  • Начальник Отдела анализа корпоративных рисков

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы аналитики данных

    Опыт более 6 лет
  • Директор по развитию бизнеса (облачная телефония)

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель PR-проектов

    Опыт 3–6 лет
  • Руководитель группы урегулирования проблемной задолженности

    Опыт 1–3 года
  • Начальник отдела электронной коммерции Департамента Эквайринга

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов (разработка под мобильные платформы)

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель направления развития бизнеса

  • Директор направления Digital по розничным продуктам

    Опыт 3-6 лет
  • Руководитель проектов по развитию собственных производств

    Опыт более 6 лет