Основные индикаторы
Данные с задержкой 15 мин.
USD/RUB
+0,15
57,58
EUR/RUB
+0,35
68,08
РТС
–0,93%
1137,12
ММВБ
–0,72%
2079,39
Brent
–0,81%
57,51
Золото
+0,45%
1290,20
S&P500
+0,07%
2561,26
NASDAQ
+0,01%
6624,22
FTSE 100
–0,58%
7499,34
NIKKEI
+0,40%
21448,52
Срочно
IT и медиа

Российские ученые создали программу для анализа иммунитета

Группа учёных из Института биоорганической химии РАН разработала многофункциональный браузер VDJviz для работы с большими объёмами данных, получаемых с помощью современных средств анализа последовательностей ДНК. Результаты работы опубликованы в журнале BMC Genomics.

Разработка позволит ускорить процесс анализа данных новой области знаний – иммуногеномики, что поможет создать методы терапии серьёзных заболеваний, связанных с нарушением формирования и функционирования системы адаптивного иммунитета.

«Программа получила своё название – VDJviz – от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител (или иммуноглобулинов – растворимой формы антиген-распознающего рецептора В-клеток): V – variable, D – diversity и J – joining. Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета – защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», - отметил кандидат биологических наук, научный сотрудник Лаборатории сравнительной и функциональной геномики Института биоорганической химии РАН Иван Звягин.

В ходе VDJ-рекомбинации по одному фрагменту из каждой группы V, D и J соединяются вместе, образуя уникальную последовательность, кодирующую антиген-распознающий участок рецептора. Такой процесс происходит в организме множество раз при созревании каждой В- или Т-клетки, в результате чего формируется огромный набор В- и Т-клеток каждая из которых имеет уникальную структуру антиген-распознающего рецептора. Вся совокупность вариантов структуры этих рецепторов называется В- или Т-клеточным репертуаром.

Авторы работы отмечают, что cовременные методы молекулярной биологии позволяют определять кодируюущие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов – технология RepSeq. Обработка таких данных с помощью различных инструментов биоинформатики помогает исследователям восстанавливать репертуары клеток системы адаптивного иммунитета.

Основными преимуществами программы являются: поддержка форматов шести самых популярных инструментов для обработки данных RepSeq (MiTCR, MIGEC, MiXCR, IgBlast, IMGTHighVQuest, ImmunoSEQ), удобный графический интерфейс, наглядное представление характеристик последовательностей гипервариабельных рецепторов, возможность сравнения образцов между собой по многим параметрам, удобный экспорт полученных данных.

Цифра дня
335
млрд долларов
  • потеряла мировая экономика от антироссийских санкций
  • являются потенциальными банкротами
  • оцениваются затраты на строительство 5 млн кв. м жилья для реновации
  • превысила цена на нефть Brent
  • составил штраф для Telegram за отказ предоставить информацию ФСБ
  • в месяц нужно жителям России, чтобы чувствовать себя счастливыми
  • потратит Москва на уличную сеть бесплатного Wi-Fi
  • посетило парк «Зарядье» за первый месяц после открытия
  • выделят в 2018 году на формирование здорового образа жизни россиян
1из10
  • «Смею вас заверить, что слухи о "смерти" нефти сильно преувеличены. Нефть останется основой мировой топливной энергетики и на перспективу 20-30 лет вперед»
    Цитата дня: Игорь Сечин, глава «Роснефти»
    Игорь Сечин,  глава «Роснефти»
  • «Объем внимания к этому вопросу (созданию крипторубля) настолько не соответствует значимости этого события, что меня потрясают просто эти дискуссии... Никакого крипторубля не будет»
    Цитата дня: Михаил Задорнов, глава ВТБ24
    Михаил Задорнов,  глава ВТБ24
  • «У нас имеется потенциал, чтобы гарантировать цифровой суверенитет. Но мы не собираемся замыкаться и строить цифровой колхоз... Мы будем продвигать наши разработки на глобальные рынки»
    Цитата дня: Дмитрий Медведев, премьер-министр РФ
    Дмитрий Медведев,  премьер-министр РФ
  • «Мы в очень серьезном хайпе по стоимости криптовалют... Этот хайп полезен для развития таких всемирных мощностей, поддерживающих на сегодня блокчейн и обеспечивающих его безопасность»
    Цитата дня: Сергей Солонин , глава ассоциации «Финтех»
    Сергей Солонин ,  глава ассоциации «Финтех»
  • «Никто у нас инфляцию не разгонит, это не облака, их не разгоняют. Исчерпаются временные факторы, и инфляция вернётся к тому уровню, на котором находится монетарная (инфляция) сейчас»
    Цитата дня: Ксения Юдаева, первый зампред ЦБ
    Ксения Юдаева,  первый зампред ЦБ
  • «Если это будет доказано (слежение "Яндекс.Такси" за телефонами клиентов), то это будет новый Вотергейт — "Яндексгейт", который может обрушить акции компании»
    Цитата дня: Дэйв Вайсер, основатель Gett
    Дэйв Вайсер,  основатель Gett
  • «Россия уважает государственные символы и, безусловно, не приемлет новый вид американского самовыражения — флаговый бандитизм»
    Цитата дня: Ирина Яровая, вице-спикер Госдумы
    Ирина Яровая,  вице-спикер Госдумы
  • «Договорились о следующем — необходимо государству осуществлять регулирование процесса эмиссии криптовалют, майнинга, процесса обращения. Государство должно взять это под контроль»
    Цитата дня: Антон Силуанов , министр финансов РФ
    Антон Силуанов ,  министр финансов РФ
  • «Россия - единственная страна, которая готова и может нанести ущерб США... Главный приоритет в области безопасности - восстановление ядерного арсенала. США не отстают от России в этом плане»
    Цитата дня: Уильям Перри, экс-глава Пентагона
    Уильям Перри,  экс-глава Пентагона
1из10